Koska munuaispotilaan aineenvaihdunta ei ole normaalia dialyysihoidosta huolimatta, tarvitaan myös lääkehoitoa. Munuaissairaudessa useiden lääkeaineiden erittyminen virtsaan vähenee ja niiden annostus tulee tarkistaa munuaisten toiminnan mukaan. Joitain lääkkeitä ei voi käyttää lainkaan vaikeassa munuaisten vajaatoiminnassa. Jotkut lääkeaineet taas poistuvat dialyysin yhteydessä. Lääkärit ja hoitajat antavat yksilöllisen ohjauksen lääkkeistä ja milloin mikäkin lääke tulee ottaa. Lääkehoitoa tarvitaan kohonneen verenpaineen, kalsium-fosfori -tasapainon sekä anemian hoitoon.

Muiden sairauksien hoitoon saatetaan tarvita sydänlääkkeitä, diabeteslääkkeitä ja kipulääkkeitä.